Colegiul Medicilor din România (CMR) a fost înfiinţat în 1995. În prezent, CMR funcţionează în baza Legii nr. 95/2006 privind reforma în domeniul Sănătăţii.
Primele organe de conducere au fost alese în 1996. Din conducere făceau parte prof. dr. Mircea Cinteză (preşedinte), dr. Dragoş Nicolescu (vicepreşedinte), dr. Francisc Baranyi (vicepreşedinte), prof. dr. N. Maier (vicepreşedinte), dr. Ion Berciu (secretar general). În lunile următoare au avut loc câteva schimbări, au intrat în conducere dr. Gheorghe Borcean şi prof. dr. Liviu Cocora.
În iunie 1997 a avut loc prima Adunare Generala a Colegiului Medicilor din România.
În 2000 au avut loc alegeri. Preşedinte a rămas prof. dr. Mircea Cinteză. Au mai fost aleşi dr. Gheorghe Borcean (vicepreşedinte), prof. dr. Liviu Cocora (vicepreşedinte), dr. Constantin Cârstea (vicepreşedinte) si prof. dr. Vasile Astărăstoae (secretar general).
În urma alegerilor de la sfârşitul anului 2007, au fost aleşi prof. dr. Vasile Astărăstoae (preşedinte), dr. Gheorghe Borcean (vicepreşedinte), dr. Constantin Cârstea (vicepreşedinte), prof. dr. Vlad Tica (vicepreşedinte) şi dr. Viorel Rădulescu (secretar general).
În ziua de 22 decembrie 2011 au avut loc alegeri. Conducerea aleasă atunci a fost formată din prof. dr. Vasile Astărăstoae (preşedinte), dr. Gheorghe Borcean (vicepreşedinte), dr. Constantin Cârstea (vicepreşedinte), dr. Călin Bumbuluţ (vicepreşedinte) şi dr. Viorel Rădulescu (secretar general).
În ziua de 23 martie 2016 a fost ales un nou Birou Executiv. Acesta a fost format din dr. Gheorghe Borcean (preşedinte), dr. Constantin Cârstea (vicepreşedinte), prof. dr. Emanoil Ceausu (vicepreşedinte), dr. Călin Bumbuluţ (vicepreşedinte) și dr. Gabriela Dascal (secretar general).
În data de 23 octombrie 2020 au avut loc alegeri la Colegiul Medicilor din România, în urma cărora au fost desemnați prof. dr. Daniel Coriu (preşedinte), dr. Valeria Herdea (vicepreşedinte), dr. Gheorghe Borcean (vicepreşedinte), dr. Călin Bumbuluţ (vicepreşedinte) și dr. Gindrovel Dumitra (secretar general).
